Ito ang Linux app na pinangalanang FastQC na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang v0.12.1sourcecode.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang FastQC sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
FastQC
DESCRIPTION
Ang FastQC ay isang tool sa pagsusuri ng kalidad ng kontrol na idinisenyo upang makita ang mga potensyal na problema sa mga dataset ng pagkakasunud-sunod ng mataas na throughput. Ang layunin nito ay magbigay ng simpleng paraan kung saan masusuri ang kalidad ng raw sequence data na nagmumula sa high throughput sequencing pipelines. Ginagawa ito sa pamamagitan ng pagpapatakbo ng isang modular na hanay ng mga pagsusuri sa isa o higit pang mga raw sequence na file sa fastq o bam na format. Pagkatapos ay gumagawa ito ng isang ulat na nagbubuod ng mga resulta, at nagha-highlight sa anumang mga lugar kung saan ang library ay maaaring lumitaw na hindi karaniwan. Dapat itong idirekta sa iyo kung saan maaaring magkaroon ng mga problema ang iyong data at magbibigay-daan sa iyong gumawa ng mga kinakailangang hakbang upang itama ito bago gumawa ng anumang karagdagang pagsusuri.
Ang FastQC ay hindi nakatali sa anumang partikular na uri ng pamamaraan ng pagkakasunud-sunod, kaya maaari itong magamit upang tumingin sa mga aklatan ng iba't ibang uri ng eksperimento (Genomic Sequencing, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq atbp atbp).
Mga tampok
- Nag-i-import ng data mula sa BAM, SAM o FastQ na mga file
- Nag-aalok ng mabilis na pangkalahatang-ideya na nagha-highlight ng mga potensyal na lugar ng problema
- Buod ng mga graph at talahanayan para sa mabilis na pagtatasa ng data
- I-export ang mga resulta sa HTML
- Maaaring gamitin offline
Wika ng Programming
Java
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
