Ito ang Linux app na pinangalanang FishingCNV upang tumakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang FishingCNV_1.5.3.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang FishingCNV para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
FishingCNV upang tumakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang FishingCNV, isang software tool na binuo sa McGill University, ay isang tool para sa komprehensibong pagsusuri ng mga bihirang pagkakaiba-iba ng numero ng kopya sa high-throughput na exome sequencing data. Ang mga input ay mga standard coverage file na ginawa ng Genome Analysis ToolKit (GATK), at ang output ay isang file na naglalaman ng mga putative CNV.Ang programa ay dumating sa 2 magkaibang mga release
* Bersyon ng GUI (FishingCNV_X.XXzip)
* Bersyon ng command line (FishingCNV_X.X_pipeline)
Mag-browse sa aming mga file upang mahanap ang iba't ibang mga release.
Mga tampok
- Graphical User Interface
- Pagsusuri ng CNV para sa katugmang pagsubok/kontrol (hal. cancer/tumor)
- Pagsusuri ng CNV para sa mga hindi tugmang sample
- Batch-effect na pagtanggal sa loob ng control set
- Maaaring matingnan ang tab-delimited na output sa Excel
- Maaaring makita ang karagdagang output file sa IGV
- Distribution plots at outlier plots para sa bawat chromosome
Audience
Agham/Pananaliksik, Edukasyon
Interface ng gumagamit
Java Swing
Wika ng Programming
Java, S/R
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/fishingcnv/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
