Ito ang Linux app na pinangalanang lr2rmats na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang lr2rmats na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA SCREENSHOT:
lr2rmats
DESCRIPTION:
Ang lr2rmats ay isang light-weight pipeline na nakabatay sa Snakemake na idinisenyo upang magamit ang parehong third-generation long-read at second-generation short-read na RNA-seq na data upang makabuo ng pinahusay na gene annotation file. Ang bagong nabuong annotation file ay maaaring ibigay sa rMATS para sa differential alternative splicing analysis.
Ang karagdagang impormasyon ay matatagpuan sa https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
Mga tampok
- Mahabang basahin
- RNA-seq
- Alternatibong splicing
- Mga Bioscience sa Pasipiko
- Mga Teknolohiya ng Oxford Nanopore
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Unix Shell, Python, C
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.