Ito ang Linux app na pinangalanang miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang mirnaTA_v1.2.3.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) upang tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) upang tumakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang microRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) ay isang bioinformatics na tool na maaaring magamit upang matukoy ang naiibang ipinahayag na mga miRNA sa mga temporal na pag-aaral. Ito ay ipinatupad sa Perl at R package (>= 2.13.0) at maaaring patakbuhin sa maraming platform gaya ng Linux, Mac at Windows. Kinakailangan ng mirnaTA na ang mga user ay magbigay ng data mula sa hindi bababa sa dalawang time point at magsuri ng hanggang 20 time point. Upang gawing normal ang data at alisin ang teknikal na pagkakaiba-iba, ginamit ang Normal Quantile Transformation (NQT), at ang na-normalize na data ay sinusuri gamit ang linear regression model upang mahanap ang anumang mga miRNA na naiibang ipinahayag sa isang linear na paraan. Anumang mga miRNA na may P-value <0.05 ay itinuturing na makabuluhan sa istatistika. Ang mga natitirang miRNA na hindi umaangkop sa linear na modelo ay higit pang sinusuri sa dalawang magkaibang pamamaraan: (1) kung ang bilang ng mga time point <3, CDF ng normal na distribution, at (2) kung ang bilang ng mga time point ay >= 3, Ginagamit ang ANOVA.http://www.gigasciencejournal.com/content/3/1/20
Mga tampok
- miRNA Temporal Analyzer
- Normal Quantile Transformation (NQT)
- hanggang 20 time point
- R package
- Perl
- heatmap
- madaling tumakbo
- graphic na HTML interface
- simpleng output
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
Perl
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/mirnata/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
