Ito ang Linux app na pinangalanang MPICorMat na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang MPICorMat_v3.0.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang MPICorMat na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MPICorMat
Ad
DESCRIPTION
Ang MPICorMat ay isang parallel na tool upang bumuo ng mga correlation similarity matrice bilang bahagi ng pamamaraan upang makabuo ng mga gene co-expression network. Kinukuha ng tool na ito bilang input ang isang matrix na may mga expression na value (isang float value) para sa iba't ibang gene na naobserbahan mula sa ilang sample. Ito ay isang parallelization ng unang module ng RMTGenNet tool (https://github.com/spficklin/RMTGeneNet). Maaaring ipagpalit ng mga user ng RMTGeneNet ang CCM module na ito sa pamamagitan ng MPICorMat, makinabang sa mabilis nitong pag-compute para makabuo ng pagkakatulad
matrix, at pagkatapos ay gamitin ang similarity matrix bilang input para sa pangalawang module (RMM) sa
bumuo ng panghuling gene co-expression network.
Audience
Information Technology, Healthcare Industry, Science/Research
Interface ng gumagamit
Console/Terminal, Command-line
Wika ng Programming
C + +
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/mpicormat/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
