Ito ang Linux app na pinangalanang PB-sQF_BacterialTyping na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang PBsQF_Mac.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang PB-sQF_BacterialTyping gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA SCREENSHOT:
PB-sQF_BacterialTyping
DESCRIPTION:
Probability Binning - signature Quadratic Form, PB-sQF, mga uri ng hindi alam na pagkakasunud-sunod sa isa sa 628 bacterial library genome na nagbibigay ng pinakamaliit na istatistika ng pagsubok kaya karamihan sa mga katulad na strain ng library.
Ang input file ay ang k-mer counts ng hindi kilalang assembled genome sequence o raw short reads file sa decimal na format na nabuo ng KAnalyze na binuo ni P. Audano et al. (https://sourceforge.net/projects/kanalyze/).
Kasama sa pag-download ang index ng library, ang pangalan ng library at sample na hindi alam.
Mga tampok
- Kinakalkula ang mga istatistika ng pagsubok sa pagitan ng library at hindi kilalang k-mer frequency
- Pag-type ng pagkakasunud-sunod ng bakterya
- Windows
- Kapote
Wika ng Programming
MATLAB
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/pb-sqf-bacterialtyping/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.