Ito ang Linux app na pinangalanang Transcriptome assembly ORA na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang saccharomyces_cerevisiae_3Mreads_ordered.sam.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Transcriptome assembly ORA para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
Transcriptome assembly ORA na tatakbo sa Linux online
Ad
DESCRIPTION
Software para sa reference-based transcriptome reconstruction. Nagsasagawa ito ng muling pagtatayo simula sa mga maikling pagbabasa na nakuha mula sa RNA-seq. Ito ay pinakaangkop upang pamahalaan ang mga transcriptome ng mas mababang mga eukaryote na may mababang bilang ng mga intron bawat gene at maaari rin itong gamitin para sa mga procariotes.Kailangan nito ng SAM file na may mga nabasang nakahanay sa reference genome at (opsyonal) ng gff file na may posisyon ng mga gene sa reference na genome.
Nagbibigay ito sa output ng mga posisyon ng mga transcript na natukoy, ang mga pangalan ng transcript batay sa mga gene na nasa gff file at sa laki ng mga rehiyon ng UTR.
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Perl
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/transcriptomeassemblyora/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
