Ito ang Windows app na pinangalanang AmPEP at AxPEP na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang deep-ampep30-test_set.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang AmPEP at AxPEP gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MGA SCREENSHOT:
AmPEP at AxPEP
DESCRIPTION:
Ang mga antimicrobial peptides (AMP) ay mga promising na kandidato sa paglaban sa mga pathogen na lumalaban sa multidrug dahil sa malawak nitong hanay ng mga aktibidad at mababang toxicity. Gayunpaman, ang pagkilala sa mga AMP sa pamamagitan ng wet-lab experiment ay mahal pa rin at nakakaubos ng oras. Ang AmPEP ay isang tumpak na computational method para sa AMP prediction gamit ang random forest algorithm. Ang modelo ng hula ay batay sa mga pattern ng pamamahagi ng mga katangian ng amino acid kasama ang pagkakasunud-sunod. Ang aming pinakamainam na modelo, ang AmPEP na may 1:3 data ratio ay nakakuha ng napakataas na katumpakan na 96%, MCC na 0.9, AUC-ROC na 0.99 at Kappa statistic na 0.9. Nahihigitan ng AmPEP ang mga kasalukuyang pamamaraan na may kinalaman sa katumpakan, MCC, at AUC-ROC kapag sinubukan gamit ang mga benchmark na dataset.Mga tampok
- source code ng MATLAB
- Mga dataset ng AmPEP
- Pag-aaral ng machine
- bioinformatics
- Pagkakasunud-sunod ng peptide
- Pagtuklas ng droga
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/axpep/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.