Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut ampliconnoise'dir.
Program:
ADI
AmpliconNoise - yüksek verimli nükleotid dizisi verilerinden gürültüyü kaldırın
VERSION
Bu belge, 1.22 sürümüne atıfta bulunur
SİNOPSİS
Yerimizi /usr/share/doc/ampliconnoise/Doc.pdf.gz nasıl çalıştırılacağına dair ayrıntılar için.
TANIM
Aşağıdaki araçlar dahildir. Çoğunun bir MPI eşdeğeri vardır, örneğin
SeqNoise, mpirun ile kullanılabilen eşdeğer bir SeqNoiseM'ye sahiptir.
FastaBenzersiz - fasta dosyasını yeniden kopyalar
-in dize giriş dosyası adı
Seçenekler:
Fküme
-in dize mesafesi giriş dosyası adı
-out dize çıktı dosyası saplaması
Seçenekler:
-r çözünürlük
-ortalama bir bağlantı
-w ağırlıkları kullan
- tanımlayıcıları okudum
-s ölçekli dist.
NDist - bir fasta dosyasından ikili Needleman-Wunsch dizisi mesafe matrisi
-in dize fata dosya adı
Seçenekler:
-i çıktı tanımlayıcıları
Perseus - canavarları öldürür
-sin dize seq dosya adı
Seçenekler:
-tin dize referans dizisi dosyası
-a çıktı hizalamaları
-d kullanım dengesizliği
-rin dize arama dosyası adı
PyroDist - akış diyagramlarından ikili mesafe matrisi
-in dize akış dosyası adı
-çıkış saplaması dosya saplaması
Seçenekler:
-ni dat dosyasında dizin yok
-rin dize arama dosyası adı
Ateş Gürültüsü - hizalamalar olmadan akış şemalarını kümeler
-din dize akış dosyası adı
-out dize kümesi girdi dosyası adı
-lin dize listesi dosyası
Seçenekler:
-v ayrıntılı
-c çift ilk kesme
-ni dat dosyasında dizin yok
-s çift hassasiyet
-rin dosyası arama dosyası adı
Sıra Dağılımı - bir fasta dosyasından ikili mesafe matrisi
-in dize fasta dosya adı
Seçenekler:
-i çıktı tanımlayıcıları
-rin dize arama dosyası adı
SeqGürültü - küme dizileri
-in dize dizisi dosya adı
-din dize mesafe matrisi dosya adı
-out dize kümesi girdi dosyası adı
-lin dize listesi dosyası
Seçenekler:
-min eşleme dosyası
-v ayrıntılı
-c çift ilk kesme
-s çift hassasiyet
-rin dize arama dosyası adı
BölünmüşKümeÇift
-din dizesi dat dosya adı
-min dize haritası dosya adı
-tin dize ağacı dosya adı
-s bölünmüş boyut
-m min boyutu
onworks.net hizmetlerini kullanarak ampliconnoise çevrimiçi kullanın
