İngilizceFransızcaİspanyolca

OnWorks favicon'u

bowtie2-build - Bulutta Çevrimiçi

Bowtie2-build'i Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü üzerinden OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırın

Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen bowtie2-build komutudur.

Program:

ADI


bowtie2-build - bowtie2-build-* için sarıcı

SİNOPSİS


papyon2-yapı [seçenekleri]*

TANIM


Bowtie 2 sürüm 2.2.6, Ben Langmead tarafından (langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea)

referans_in
ref dizili dosyaların virgülle ayrılmış listesi

bt2_index_base
bt2 verilerini bu dir/basename ile dosyalara yaz

*** Bowtie 2 dizinleri yalnızca v2 ile çalışır (v1 değil). Aynı şekilde v1 dizinleri için. ***

SEÇENEKLER


-f referans dosyaları Fasta'dır (varsayılan)

-c cmd satırında verilen referans dizileri (as )

--büyük-indeks
ref 4 milyardan az olsa bile, oluşturulan endeksi 'büyük' ​​olmaya zorlayın
nükleotidleri

-a/--otomatik değil
otomatik devre dışı bırak -p/--bmax/--dcv bellek uydurma

-p/--paketlenmiş
paketlenmiş dizeleri dahili olarak kullanın; daha yavaş, daha az bellek

--bmaks
bloklu sonek dizisi oluşturucu için maksimum kova sz

--bmaxdivn
ref len'in böleni olarak max kova sz (varsayılan: 4)

--dcv
blok bazında diff-cover periyodu (varsayılan: 1024)

--nodc diff-cover'ı devre dışı bırak (algoritma ikinci dereceden olur)

-r/--noref
.3/.4 dizin dosyaları oluşturmayın

-3/--sadece referans
sadece .3/.4 dizin dosyaları oluşturun

-o/--offrate
SA, her 2^'de bir örneklenir BWT karakterleri (varsayılan: 5)

-t/--ftabchar'lar
İlk aramada tüketilen karakter sayısı (varsayılan: 10)

--tohum
rastgele sayı üreteci için tohum

-q/--sessizlik
ayrıntılı çıktı (hata ayıklama için)

-h/--Yardım
aracın ayrıntılı açıklamasını ve seçeneklerini yazdırın

--kullanım
bu kullanım mesajını yazdır

--versiyon
sürüm bilgilerini yazdır ve çık

onworks.net hizmetlerini kullanarak bowtie2-build çevrimiçi kullanın


Ücretsiz Sunucular ve İş İstasyonları

Windows ve Linux uygulamalarını indirin

  • 1
    PAC Yöneticisi
    PAC Yöneticisi
    PAC, bir Perl/GTK yedeğidir
    SecureCRT/Putty/vb (linux
    ssh/telnet/... gui)... Bir GUI sağlar
    bağlantıları yapılandırmak için: kullanıcılar,
    parolalar, BEKLENEN düzenleme...
    PAC Yöneticisini İndirin
  • 2
    GeoServer
    GeoServer
    GeoServer açık kaynaklı bir yazılımdır
    Java ile yazılmış, kullanıcılara izin veren sunucu
    coğrafi verileri paylaşmak ve düzenlemek için.
    Birlikte çalışabilirlik için tasarlanmış,
    da yayınlıyor...
    GeoServer'ı İndirin
  • 3
    ateşböceği III
    ateşböceği III
    Ücretsiz ve açık kaynaklı bir kişisel finans
    müdür. Firefly III özellikleri
    çift ​​girişli defter tutma sistemi. Yapabilirsiniz
    hızlı bir şekilde girin ve düzenleyin
    işlemler ben...
    Firefly III'ü İndirin
  • 4
    Apache OpenOffice Uzantıları
    Apache OpenOffice Uzantıları
    Apache'nin resmi kataloğu
    OpenOffice uzantıları. Bulacaksın
    sözlüklerden çeşitli uzantılar
    PDF dosyalarını içe aktarmak ve bağlanmak için araçlar
    harici ile...
    Apache OpenOffice Uzantılarını İndirin
  • 5
    MantisBT
    MantisBT
    Mantis, kolayca dağıtılabilen bir web
    ürün hatasına yardımcı olmak için tabanlı bugtracker
    izleme. PHP, MySQL ve bir
    Web sunucusu. Demomuza göz atın ve barındırılan
    teklif...
    MantisBT'yi indirin
  • 6
    LAN Messenger
    LAN Messenger
    LAN Messenger bir p2p sohbet uygulamasıdır
    intranet iletişimi için ve
    bir sunucu gerektirir. çeşitli kullanışlı
    özellikler de dahil olmak üzere desteklenir
    bildir...
    LAN Messenger'ı indirin
  • Daha fazla »

Linux komutları

Ad