Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen bp_bioflat_index komutudur.
Program:
ADI
bp_bioflat_index.pl - Bio::DB::Flat kullanarak dizin dizini dosyaları
TANIM
ile indekslenmiş bir biyolojik dizi veri tabanı oluşturun veya güncelleyin.
Bio::DB::Düz indeksleme şeması. Argümanlar, düz dosyaların bir listesidir
dizine eklenecek dizi bilgilerini içerir.
KULLANIM
bp_bioflat_index.pl dosya1 dosya2 dosya3...
Seçenekler:
--create Dizini oluşturun veya yeniden başlatın. Belirtilmemişse,
dizin zaten mevcut olmalıdır.
--biçim Sıra dosyalarının biçimi. bir olmalı
"genbank", "swissprot", "embl" veya "fasta".
--yer Dizin dosyalarının bulunduğu dizine giden yol
saklanır.
--dbname Oluşturulacak veritabanının sembolik adı.
--indextype Oluşturulacak dizin türü. Ya "bdb" ya da "düz".
"ikili arama", "düz" ile aynıdır.
Seçenekler kısaltılabilir. Örneğin, --indextype için -i kullanın.
Karşılık gelen seçenekler varsa, aşağıdaki ortam değişkenleri varsayılan olarak kullanılacaktır.
sağlanmaz:
OBDA_FORMAT dizi dosyasının biçimi
OBDA_LOCATION dizin dosyalarının saklandığı dizine giden yol
OBDA_DBNAME veritabanının adı
OBDA_INDEX oluşturulacak dizin türü
onworks.net hizmetlerini kullanarak bp_bioflat_index'i çevrimiçi kullanın
