Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen createChemistryHeader komutudur.
Program:
ADI
createChemistryHeader.py - PacBio sıralama kimyası ile bir SAM başlığı oluştur
bilgi
TANIM
kullanım: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES...]
girdi_hizalama_dosyası çıktı_başlık_dosyası
createChemistryHeader tarafından kullanılan kimya bilgilerini içeren bir SAM başlığı oluşturur.
Titreme.
konumsal argümanlar:
girdi_hizalama_dosyası
BLASR tarafından üretilen bir SAM veya BAM dosyası.
çıktı_başlığı_dosyası
Kimya bilgileriyle oluşturulacak SAM veya BAM başlık dosyasının adı
yüklendi.
isteğe bağlı argümanlar:
-h, --yardım et
bu yardım mesajını göster ve çık
- hata ayıklama
Çıktı ayrıntılı günlük bilgileri. (varsayılan: Yanlış)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ...]
içinde hizalanmış okumaları içeren bas veya bax dosyaları
input_alignment_file. Ayrıca bir dizi bas veya bax dosyası olabilir. (varsayılan: Yok)
onworks.net hizmetlerini kullanarak createChemistryHeader'ı çevrimiçi kullanın
