Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen domainrepe komutudur.
Program:
ADI
domainrep - Temsili yapıları tanımlamak için DCF dosyasını yeniden sıralayın.
SİNOPSİS
etki alanı temsilcisi -dcfin dosyası dosyada düğüm liste -dcfout dosyası dış dosya
etki alanı temsilcisi -Yardım
TANIM
etki alanı temsilcisi EMBOSS'un (“Avrupa Moleküler Biyoloji Açık
Yazılım Paketi”). "Protein:3D Structure" komut grup(lar)ının bir parçasıdır.
SEÇENEKLER
Giriş Bölüm
-dcfin dosyası dosyada
Bu seçenek, DCF dosyasının (etki alanı sınıflandırma dosyası) (giriş) adını belirtir. A
'alan sınıflandırma dosyası', alan adları için sınıflandırma ve diğer verileri içerir.
SCOP veya CATH, DCF formatında (EMBL benzeri). Dosyalar SCOPPARSE kullanılarak oluşturulur.
ve KATPARSE. Alan adı sırası bilgisi kullanılarak dosyaya eklenebilir.
DOMAINSEQS.
gereklidir Bölüm
düğüm liste
Bu seçenek, dosyayı yeniden sıralamadan önceki düğümü belirtir. Yeniden sıralama yapılabilir
SCOP veya CATH hiyerarşilerinde belirtilen herhangi bir düğüm. Örneğin, 'Sınıf' seçerek
aynı Sınıfa ait girişler sırayla yeniden sıralanacaktır. Varsayılan değer: 1
Çıktı Bölüm
-dcfout dosyası dış dosya
Bu seçenek, DCF dosyasının (etki alanı sınıflandırma dosyası) (çıktı) adını belirtir. A
'alan sınıflandırma dosyası', alan adları için sınıflandırma ve diğer verileri içerir.
SCOP veya CATH, DCF formatında (EMBL benzeri). Dosyalar SCOPPARSE kullanılarak oluşturulur.
ve KATPARSE. Alan adı sırası bilgisi kullanılarak dosyaya eklenebilir.
DOMAINSEQS. Varsayılan değer: test.scop
onworks.net hizmetlerini kullanarak domainrepe'yi çevrimiçi kullanın
