Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen fastaq-to_perfect_reads komutudur.
Program:
ADI
fastaq_to_perfect_reads - Referanstan mükemmel eşleştirilmiş okumalar yap
TANIM
kullanım: fastaq_to_perfect_reads [seçenekler]
sapma>
Örneklenen ekleme boyutlarıyla, bir dizi dosyasından mükemmel eşleştirilmiş hızlı okumalar yapar
normal bir dağılım. Okuma oryantasyonu innie'dir. Çıktı, serpiştirilmiş bir FASTQ dosyasıdır.
konumsal argümanlar:
infile Giriş dosyasının adı
dış dosya
Çıktı dosyasının adı
ortalama uç boyutu
Okuma çiftlerinin ortalama ekleme boyutu
standart sapma ekle
Uç boyutunun standart sapması
ortalama kapsama
Okumaların ortalama kapsamı
okuma uzunluğu
Her okumanın uzunluğu
isteğe bağlı argümanlar:
-h, --yardım et
bu yardım mesajını göster ve çık
--parça DOSYA ADI
Parçaların FASTA dizilerini yazın (yani çiftleri ve aralarındaki dizileri okuyun)
verilen dosya adına
--olmayan Okumalarda N veya n karaktere izin verme
--tohum INT
Rastgele sayı üreteci için tohum. Varsayılan, python'un varsayılanını kullanmaktır
onworks.net hizmetlerini kullanarak fastaq-to_perfect_reads çevrimiçi kullanın
