Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen fill-ref-md5 komutudur.
Program:
ADI
fill-ref-md5 - referans dizisinin MD5 toplamını hesaplar
SİNOPSİS
dolgu-ref-md5 [SEÇENEKLER] in.vcf.gz out.vcf.gz
TANIM
Hakkında: Komut dosyası, referans dizisinin MD5 toplamını hesaplar ve ekler
VCFv4.1 tarafından önerildiği gibi 'referans' ve 'contig' etiketlerini başlığa yerleştirin. VCF dosyası
yıldırım hızından yararlandığı için sıkıştırılmalı ve tabix dizine eklenmelidir
tabix yeniden başlık işlevi.
SEÇENEKLER
-d, --sözlük
Hesaplanan MD5'lerin nerede okunacağı/yazılacağı. Ekleme modunda açıldı, mevcut kayıtlar
dokundu.
-i, --bilgi
Referans derleme (AS), türler (SP), taksonomi (TX) hakkında isteğe bağlı bilgiler
-r, --refseq
samtools faidx tarafından indekslenen fasta formatındaki referans dizisi
-h- ?, --yardım et
Bu yardım mesajı.
ÖRNEKLER
fill-ref-md5 -i AS:NCBIM37,SP:"Mus\ Musculus" -r NCBIM37_um.fa
-d NCBIM37_um.fa.dict giriş.vcf.gz çıkış.vcf.gz
onworks.net hizmetlerini kullanarak fill-ref-md5'i çevrimiçi kullanın