Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen gbrowse_import_ucsc_db komutudur.
Program:
ADI
göz atma_import_ucsc_db - Bir çerçeve veri kaynağı oluşturur
TANIM
Bu, UCSC Genomu tarafından bilinen genomlardan biri için bir çerçeve veri kaynağı oluşturur.
Tarayıcı. Daha sonra veri kaynağı yapılandırma dosyasını değiştirebilir, kendi verilerinizi ekleyebilir ve böylece
ileri. UCSC genom yapısının adını ve isteğe bağlı olarak görüntülenecek bir açıklamayı sağlayın
GB göz atın.
Başlamak için şuraya giderek istediğiniz veri kaynağını bulun: http://genome.ucsc.edu/cgi-
bin/hgGateway ve istenen türlere gitmek için "klad" ve "genom" menülerini kullanma
ve yapı numarası. Veri kaynağı adını navigasyonun altındaki mavi kutuda bulacaksınız
kontroller. Bunun gibi bir şey arayın:
D. melanogaster Genom Tarayıcısı – dm3 derlemesi (diziler)
Veri kaynağı adı "assembly" sözcüğünden önce görünür, bu durumda "dm3".
KULLANIM
[seçenekler] [ ]
SEÇENEKLER
UCSC tarafından tanınan tüm kaynakların bir listesini almak için şunu yazın:
göz atma_import_ucsc_db --list
Seçenekler:
--remove-chr Tüm kromozom adlarından 'chr' önekini kaldırın
--list Veri kaynaklarını listele
ÖRNEK
Örnek: $0 hg19 'İnsan genomu (hg19)'
Onworks.net hizmetlerini kullanarak growse_import_ucsc_db'yi çevrimiçi kullanın
