mincstats - Bulutta Çevrimiçi

Program:

ADI

mincstats - bir minc dosyasının vokselleri arasında basit istatistikleri hesaplayın

SİNOPSİS

mincstat'lar [ ] .mnc

TANIM

Mincstat'lar bir minc dosyasının tüm voksellerinde basit istatistiksel ölçümleri hesaplayacaktır.
Bunların voksel bazında ölçümler değil, küresel istatistiksel ölçümler olduğuna dikkat edin (bkz.
küçük ortalama bunun için). Varsayılan olarak tüm istatistikler hesaplanır. herhangi bir istatistik varsa
komut satırı seçeneği aracılığıyla istenirse, yalnızca istenen istatistikler yazdırılır.

Bu programın çok kullanışlı bir özelliği, voksel setini kısıtlama yeteneğidir.
ya dahil edilen değerlerin aralığını kısıtlayarak istatistik hesaplamasına dahil edilir,
veya sınırlı bir aralığa sahip bir maske dosyası kullanarak. Giriş dosyası için birden çok aralık veya
maske dosyası belirtilebilir. Dahil edilen hacim değerlerinin her aralığı ve her aralık için
maske değerleri için ilgili istatistikler yazdırılır (n*m değerleri, burada n sayıdır
hacim aralıkları ve m maske aralıklarının sayısı). Bu hesaplamalar tek
verileri iletir, bu nedenle birden çok aralık belirtmek, verileri çalıştırmaktan çok daha hızlıdır.
tekrar tekrar programlayın. Bu, bir çok bölgesel ortalamayı hesaplarken oldukça yararlıdır.
VOI maske hacmi.

Histogramlara ve ilgili istatistiksel önlemlere özel olarak değinilmelidir. NS
histogramın varsayılan aralığı, dosyadaki en küçük değerden en büyüğüne kadardır. İçinde
histogram kutularının sayısının tam olarak eşleştiği nadir olmayan, ancak özel durum
dosyadaki olası değerlerin sayısı (örneğin tam aralıklı bayt verileri için 256 kutu),
histogram, varsayılan histogram aralığını kullanırken bazı garip özelliklerle sonuçlanabilir. Bu
daha sonra hafifçe yeniden birleştirilen verilerin ayrıklaştırılmasından kaynaklanır.
uyumsuz histgram Bayt veri örneği için kullanılması gereken değerler 256'dır.
kutular ve en küçük değerin yarım kutu ve yarım kutunun altına uzanan bir histogram aralığı
en büyüğünün üstünde. seçeneği kullan -ayrık_histogram bunu otomatik olarak çözmek veya kullanmak için
-tamsayı_histogramı giriş verileri doğal olarak tamsayıysa, birim genişlik kutularına sahip olmak
(örneğin etiket verileri). Genel olarak, ayrıklaştırılmış öğelerin yeniden düzenlenmesi konusunda dikkatli olunmalıdır.
verileri, ayrıklaştırma düzeyine yakın bir kutu boyutuna sahip bir histograma aktarır.

SEÇENEKLER

Seçeneklerin kısaltılmış biçimde (benzersiz oldukları sürece) belirtilebileceğini ve
komut satırında herhangi bir yerde verilebilir. İstatistiklerin yazdırıldığı sıra
üzerinde talep edildikleri sıraya veya sıraya bakılmaksızın her zaman aynı olacaktır.
komut satırı

genel seçenekleri

-kaba
Mevcut bir dosyanın üzerine yazın.

-noklobber
Mevcut bir dosyanın üzerine yazmayın (varsayılan).

-ayrıntılı
Ek bilgileri yazdırın (varsayılandan daha fazla).

-sessiz Yalnızca istenen numaraları yazdırın

-max_buffer_size_in_kb boyut
Dahili arabelleklerin maksimum boyutunu belirtin (kbayt olarak). Varsayılan 4 MB'dir.

Geçersiz değer seçenekleri

-ignore_nan
Geçersiz değerleri (geçerli aralığın dışında) istatistik hesaplamalarından hariç tutun. Bu
varsayılan.

-include_nan
Geçersiz değerleri sıfır olarak kabul edin ve bunları istatistik hesaplamalarına dahil edin.

-replace_nan değer
Geçersiz değerleri belirtilen değerle değiştirin ve yeni değeri
istatistik hesaplamaları.

hacim menzil seçenekleri

tabandan min1,min2, ...
İstatistiklere dahil edilecek veri aralıkları için virgülle ayrılmış alt sınırlar listesi
hesaplama.

-tavan max1,max2, ...
İstatistiklere dahil edilecek veri aralıkları için virgülle ayrılmış üst sınırlar listesi
hesaplama.

-Aralık min1,max1,min2,max2, ...
Dahil edilecek veri aralıkları için alt ve üst sınırların virgülle ayrılmış listesi
istatistik hesaplama.

-bindeğer val1,val2, ...
İstatistik hesaplamasına dahil edilecek tamsayı değerlerinin virgülle ayrılmış listesi. bir aralık
+/- 0.5, belirtilen her bir değerin etrafında tanımlanır.

- maske dosyaadi.mnc
İstatistik hesaplamasına dahil edilen verileri maskelemek için kullanılacak dosyanın adı. İçin
bunun herhangi bir etkisi olması için aşağıdakilerden biriyle bir maske aralığı belirtmelisiniz
seçenekleri.

-maske_floor min1,min2,...:
Facebok sayfasını beğenin : tabandan, ancak maske dosyasına uygulandı.

-maske_ceil max1,max2, ...
Facebok sayfasını beğenin : -tavan, ancak maske dosyasına uygulandı.

-maske_aralığı min1,max1,min2,max2, ...
Facebok sayfasını beğenin : -Aralık, ancak maske dosyasına uygulandı.

-mask_bindeğeri val1,val2, ...
Facebok sayfasını beğenin : -bindeğer, ancak maske dosyasına uygulandı.

Histogram seçenekleri

-histogram Dosya
Histogramın yazıldığı dosyanın adını belirtin. birden fazla aralık varsa
veya maske aralıkları belirtilirse, tüm histogramlar bu dosyaya yazılır,
boş satırlarla ayrılmıştır. Her bir histogramı açıklayan bilgiler önce yazılır.
hash (pound) karakteriyle başlayan satırlarda. Bu dosyalar yüklenebilir
gnuplot içine.

-hist_bins kutu sayısı
Histogramdaki kutu sayısını belirtin.

-binler kutu sayısı
eşanlamlısı -hist_bins.

-hist_kat dk
Histogram için alt sınır belirleyin.

-hist_ceil maksimum
Histogram için üst sınırı belirtin.

-hist_aralığı dk maksimum
Histogram için bir aralık belirtin

-tamsayı_histogramı
Tamsayı değerleri etrafında ortalanmış, birim genişliğinde kutular oluşturun. Bunun için yararlıdır
etiketler gibi tamsayı verileri. Histogram aralığı en yakın tam sayıya yuvarlanır,
daha sonra min düşürülür ve maksimum 0.5 yükseltilir. Kutu sayısı alınır
bu iki değerin farkı olarak. 0.01'in minimuma eklendiğini ve
sağlamak için yuvarlamadan önceki maksimum değerden çıkarılır.
doğru belirtilen aralık (örn. [0.5,255.5]) korunur. sahip olmak istiyorsan
birden daha geniş olan tamsayı kutuları, histogram aralığını hesaplamanız gerekecek
ve kutu sayısını kendiniz belirleyin ve bu seçeneği kullanmayın.

-ayrık_histogram
Histogramı giriş verilerinin ayrıklaştırılmasıyla eşleştirmeye çalışın. Bu
tamsayı gösteriminde saklanan sürekli veriler için uygun ve
ayrıklaştırmaya yakın bir bölme genişliği istendiğinde. Bu şuna benzer
-tamsayı_histogramı, histogram aralığının önce voksel'e dönüştürülmesi dışında
her iki tarafta yarım kutu ile yuvarlatılmış ve uzatılmış değerler. Bu yeni voksel
aralık daha sonra gerçek değerlere dönüştürülür. Kutu sayısı olarak alınır.
voksel değer aralığındaki fark. Bunun varyasyonları hesaba katmadığını unutmayın
dilimden dilime ölçeklemede, bu nedenle tuhaf histogram efektleri yine de ortaya çıkabilir. Bu seçenek
benzer bir davranış sergilemeyi amaçlamaktadır. hacim_stats.

-int_max_bins kutu sayısı
Yukarıdakilerle otomatik olarak boyutlandırılabilen en büyük histogramı belirtin
seçenekler. Sınır, yanlışlıkla büyük histogramların oluşturulmasını önler. Bu seçenek
eskinin yerini aldı -max_bins MINC 1.1'deki seçenek.

Basic istatistik

-herşey Tüm istatistiksel önlemleri hesaplayın. Bu varsayılandır.

-none eşanlamlısı -Miktar (volume_stats ile benzerlik için). Bu olmasına rağmen unutmayın
için gerekli hacim_stats, bunlardan herhangi birini belirttiğinizden burada gerekli değildir.
seçenekler otomatik olarak kapanır -herşey

-Miktar Aralık ve maske içindeki voksellerin sayısını sayın.

-yüzde
Aralık ve maske içindeki voksellerin yüzdesini yazdırın

-Ses
Aralık ve maske içindeki voksellerin hacmini yazdırın (mm küp olarak).

-min Minimum değeri yazdırın.

-max Maksimum değeri yazdırın.

-toplam Tüm değerlerin toplamını yazdırın.

-toplam2 Tüm değerlerin karelerinin toplamını yazdırın.

-anlamına gelmek Ortalamayı yazdırın.

-varyans
Varyansı yazdırın.

-stddev
Standart sapmayı yazdırın.

-çarpıklık
Örnek çarpıklığı yazdırın (3. an) .

-Basıklık
Kurtosis örneğini yazdırın (4. an) .

-BOM Kütle merkezini yazdırın. Hem voksel koordinatı hem de dünya koordinatları
basılmış. Voksel koordinatları dosya sırasına göre yazdırılırken, dünya
koordinatlar x,y,z sırasına göre yazdırılır.

-COM eşanlamlısı -BOM.

-world_only
Kütle merkezini yalnızca dünya koordinatlarında yazdırın.

Histogram istatistik

Histogram istatistiklerinin yalnızca histogram sayımlarından ve bin
merkezler, bu nedenle medyan gibi sonuçlar, gerçek değerle tam olarak aynı olmayacaktır.
tüm vokseller dahil. Örneğin, medyan üzerindeki hata yarım kutu kadar büyük olabilir.
Genişlik. Ayrıca, histogram aralığı dahil edilen voksellerinkinden daha az ise, o zaman
sonuç yalnızca histograma dahil edilen vokseller için geçerlidir.

-hist_count
Histogramdaki voksel sayısını yazdırın. sayısından farklı olabilir.
dahil ve maskelenmiş vokseller, eğer histogram aralığı,
dahil veriler.

-hist_percent
Histograma dahil edilen voksellerin yüzdesini yazdırın.

-medyan
Histogram medyanını yazdırın.

-çoğunluk
En çok sayıya sahip bölme için bölme merkezini (yoğunluk değeri) yazdırın.

-biModalT
Birimi iki sınıfa ayıran iki modlu eşiği yazdırın Varsayılan
otsu yöntemini kullanmak için (aşağıdaki seçeneklere bakın)

-otsu Otsu N, "Gri Seviyeden Eşik Seçim Yöntemi" bölümünde açıklanan yöntemi kullanın.
Histogramlar", IEEE Trans on Systems, Man and Cybernetics. 1979, 9:1; 62-66 to
eşiği hesapla

-yavru
İki modlu eşiği hesaplamak için Kittler&Illingworth '86 algoritmasını kullanın.
Kittler, J. & Illingworth J., "Minimum hata eşiği", Örüntü Tanıma,
cilt 19, s. 41-47, 1986.

-kapur Kapur ve ark. İki modlu eşiği hesaplamak için '85 algoritması. kapur,
Sahoo & Wong "Gri-seviyesi resim eşikleme için yeni bir yöntem.
histogram", Computer Vision, Graphics, and Image Processing, cilt 29, s
273-285, 1985.

-basit
İki modlu eşiği hesaplamak için basit ortalama ortalama algoritmasını kullanın.
bazı alternatiflerden hesaplama açısından pahalı ve
iyi iş. Ancak diğer yöntemlerden bazılarından daha sağlam görünüyor.

-pctT Histogramın belirli bir kritik yüzdesi için gereken eşiği yazdırın.

-entropi
Shannon entropisini yazdırın.

H(x) = - Toplam(P(i) * log2(P(i))

burada P(i) bin olasılığıdır

genel seçenekleri için herşey komutları:

-Yardım Komut satırı seçeneklerinin özetini yazdırın ve çıkın.

-version
Programın sürüm numarasını yazdırın ve çıkın.

onworks.net hizmetlerini kullanarak mincstats'ı çevrimiçi kullanın