Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen Psequin komutudur.
Program:
ADI
Psequin - dizileri Genbank, EMBL ve DDBJ'ye gönderin
SİNOPSİS
Payet [-b] [-bse] [-e] [-f Dosya] [-gc] [-h] [-eski] [-eski] [-oldgph] [-eskiseq]
[-eski kaynak] [-s] [-w] [-x]
TANIM
Payet dizilerin GenBank, EMBL'ye sunulmasına yardımcı olmak için tasarlanmış bir programdır,
ve DDBJ dizi veritabanları. Ulusal Biyoteknoloji Merkezi'nde yazılmıştır.
Ulusal Tıp Enstitülerindeki Ulusal Tıp Kütüphanesinin bir parçası olan bilgiler
Sağlık.
Payet basit FASTA formatından bir GenBank kaydının temel unsurlarını bir araya getirebilir
metin dosyaları. Örneğin, program bir organizmadan uygun genetik kodu alır.
adını verir ve kodlama bölgesi aralıklarını geri çeviri ile otomatik olarak belirler.
protein dizisi. Bir çevrimiçi yardım penceresi, kullanıcı olarak uygun yere kayar.
Veri giriş formları arasında ve içinde hareket ederek, hangi bilgilerin olduğuna dair ilgili ayrıntıları verir.
bekleniyor.
Payet ayrıca kalite güvencesi için bir dizi yerleşik doğrulama işlevi içerir.
Ekleme siteleri ve kodlama bölgesi çevirileri gibi özelliklerin doğruluğu kontrol edilir veya
iç tutarlılık. Bir hata mesajına çift tıklamak uygun bir düzenleyiciyi başlatır
kullanıcının herhangi bir sorunu düzeltebileceği şekilde.
Payet dahil olmak üzere çeşitli biçimlerde verilerin canlı, tıklanabilir görünümlerini sağlar.
rapor formu, GenBank düz dosyası, EMBL düz dosyası ve bir grafik görünümü. Bir üzerine çift tıklayarak
Bu biçimlerdeki herhangi bir öğe, o öğe için bir düzenleyici başlatır. Editör şunları yapabilir:
temel sıra düzenlenirken doğru özellik tablosu konumlarını korumak. Yapabilir
düzenleme sırasında dizideki özellikleri görüntüler ve özellik aralıklarının
doğrudan manipülasyon ile ayarlanır.
SEÇENEKLER
-b Bioseq-set modu
-bse ikili giriş modu
-e Giriş modu
-f Dosya
dan oku Dosya
-gc genom merkezi modu
-h otomatik yardımı kapat
-eski
eski hizalama okuyucusunu kullan
-eski
eski ASN.1 olarak bırak
-oldgph
eski grafik görünümünü kullan
-eskiseq
eski dizi görünümünü kullan
-eski kaynak
eski düz dosya kaynak biçimini kullan
-s alt araç modu
-w tezgah modu
-x standart girişten oku
onworks.net hizmetlerini kullanarak Psequin'i çevrimiçi kullanın
