Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut dizisidir.
Program:
ADI
seqwords - UniProt'un anahtar sözcük aramasından DHF dosyaları oluşturur.
SİNOPSİS
sıralı kelimeler -Anahtar dosya dosyada -sp dosyası dosyada -outfile dış dosya
sıralı kelimeler -Yardım
TANIM
sıralı kelimeler EMBOSS'un (“Avrupa Moleküler Biyoloji Açık
Yazılım Paketi”). "Protein:3D Structure" komut grup(lar)ının bir parçasıdır.
SEÇENEKLER
Giriş Bölüm
-Anahtar dosya dosyada
Bu seçenek, anahtar sözcükler dosyasının (girdi) adını belirtir. Bu bir liste içerir
tarafından kullanılan bir dizi SCOP veya CATH ailesine ve süper ailesine özgü anahtar kelimeler
Bir dizi veritabanını aramak için SEQWORDS.
-sp dosyası dosyada
Bu seçenek, aranacak dizi veritabanının (giriş) adını belirtir.
Çıktı Bölüm
-outfile dış dosya
Bu seçenek, DHF dosyasının (etki alanı isabet dosyası) (çıktı) adını belirtir. bir 'alan
isabet dosyası', etki alanı sınıflandırma bilgisine sahip veritabanı isabetlerini (dizileri) içerir,
DHF formatında (FASTA benzeri). İsabetler, bir SCOP veya CATH ailesine (veya
yapısal hiyerarşilerdeki diğer düğüm) ve bir dizi aramasından bulunur
veri tabanı. PSIBLAST tarafından alınan isabetleri içeren dosyalar,
SEQSEARCH, SIGSCAN veya çeşitli kullanılarak seyrek bir protein imzası tarafından alınan isabetler
LIBSCAN kullanarak HMM türleri ve profil. Varsayılan değer: test.hits
onworks.net hizmetlerini kullanarak çevrimiçi seqwordse kullanın
