Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen vcf-compare komutudur.
Program:
ADI
vcf-compare - bgzipped ve tabix dizinli VCF dosyalarını karşılaştırın
SİNOPSİS
karşılaştırma-vcf [SEÇENEKLER] dosya1.vcf dosya2.vcf Kendi ID’n ile mağazalarını oluştur
TANIM
Hakkında: bgzipped ve tabix dizinli VCF dosyalarını karşılaştırın. (Örn. bgzip dosyası.vcf; tabix -p vcf
dosya.vcf.gz)
SEÇENEKLER
-c, --kromozomlar
Aynısı -r, geriye dönük uyumluluk için bırakıldı. Lütfen olduğu gibi kullanmayın
gelecekte düştü.
-d, - hata ayıklama
Hata ayıklama bilgileri. Seçeneğin birden çok kez verilmesi ayrıntı düzeyini artırır
-H, --cmp-haplotipler
Sadece pozisyonları değil, haplotipleri karşılaştırın
-m, --isim eşleme
La kullan -H farklı sütun adlarına sahip dosyaları karşılaştırırken. Bunun argümanı
seçenekler virgülle ayrılmış bir liste veya bir dosyadaki satır başına bir eşlemedir. isimler
iki nokta üst üste ayrılmış ve komut satırındaki dosyalarla aynı sırada görünmelidir.
-R, --refseq
Sadece pozisyonları değil, gerçek sıralamayı karşılaştırın. La kullan -w indelleri karşılaştırmak için.
-r, --bölgeler
Verilen bölgeleri işleyin (virgülle ayrılmış liste veya bir dosyadaki satır başına bir bölge).
-s, --örnekler
Yalnızca listelenen örnekleri işleyin. İstenmeyen örnekleri hariç tutmak artabilir
performansı önemli ölçüde
-w, --kazanç
Tekrarlayan dizilerde, aynı indel farklı pozisyonlarda çağrılabilir.
Bu kadar uzaktaki kayıtları eşleşme olarak kabul edin (ister SNP ister indel olsun).
-h- ?, --yardım et
Bu yardım mesajı.
onworks.net hizmetlerini kullanarak vcf-compare çevrimiçi kullanın