Bu, en son sürümü cushaw3-v3.tar.bz3.0.3 olarak indirilebilen, çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırılacak CUSHAW2: Doğru Kısa Okuma Hizalaması adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile Linux'ta çevrimiçi olarak çalıştırmak için CUSHAW3: Accurate Short-read Alignment adlı bu uygulamayı ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
CUSHAW3: Çevrimiçi Linux'ta Çalıştırılacak Doğru Kısa Okuma Hizalaması
Ad
TANIM
CUSHAW3, açık kaynaklı paralelleştirilmiş, hassas ve doğru bir kısa okuma hizalayıcıdır. Bu hizalayıcı, hem kolay hem de zor okumaları insan genomu gibi büyük genomlara uygun şekilde hizalamak için genel bir yaklaşım önerir. CUSHAW3'ün tek uçlu ve çift uçlu hizalama açısından CUSHAW2, BWA-MEM, Bowtie2 ve GEM'den sürekli olarak daha iyi performans gösteren hizalama kalitesi gerçekleri üzerinde değerlendirme yapın. Ayrıca, hizalayıcımız, yüksek hata oranlarına sahip kısa okumalar için Novalign3'ten daha iyi eşleştirilmiş uç hizalama performansı göstermiştir.Kullanıcı arabirimi
Konsol/Terminal
Programlama dili
C + +
Bu, https://sourceforge.net/projects/cushaw3/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
