Bu, en son sürümü FOCUS_0.31_python_2.7.XX.zip olarak indirilebilen FOCUS adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
FOCUS adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
ODAK
TANIM
FOCUS, metagenomik örneklerde bulunan bol organizmaları ve bunların göreceli bolluğunu dizi uzunluğu bağımlılıkları olmaksızın profillemek ve raporlamak için negatif olmayan en küçük kareler kullanan yenilikçi ve çevik bir kompozisyon. Program, simüle edilmiş ve gerçek metagenomlarla test edildi ve sonuçlar, yaklaşımımızın rastgele topluluklardaki organizmaları öngördüğünü gösteriyor.Kullanılabilirlik ve uygulama: Python'da uygulanan kod burada ve bir web sunucusu adresinde bulunabilir. http://edwards.sdsu.edu/FOCUS.
Bağımlılıklar: Denizanası, Numpy ve Scipy.
ODAK alıntı
Silva, GGZ, DA Cuevas, BE Dutilh ve RA Edwards, 2014: FOCUS: negatif olmayan en küçük kareler kullanarak metagenomlardaki organizmaları tanımlamak için hizalamasız bir model. PeerJ, 2, e425,doi:10.7717/peerj.425.
Özellikler
- metagenomlar
- zenginlik
- eşitlik
Bu, https://sourceforge.net/projects/metagenomomefocus/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
