Bu, en son sürümü GapFiller-1.1.1.zip olarak indirilebilen GapFiller adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
GapFiller adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
Boşluk Doldurucu
Ad
TANIM
GapFiller, eşleştirilmiş okumalar içindeki boşluğu doldurmak için tohumlama ve genişletme yerel birleştiricidir.
Hem DNA hem de RNA için kullanılabilir ve Illumina verileri üzerinde test edilmiştir.
GapFiller, dizi uzunluğunun gevşek bir tahmini sağlandığı takdirde, uçlarında bulunan okumalardan başlayarak bir dizi birleştirilecek olduğunda kullanılabilir.
Özellikler
- Desteklenen giriş formatı: FASTQ (.gz, .bz2), FASTA (.gz, .bz2), SAM, BAM
- Son derece özelleştirilebilir montaj parametreleri
- Tohumlama ve montaj için farklı veri kümeleri belirleme imkanı
- Düzen bilgilerini saklama imkanı (birleştirilmiş bitişikler içindeki konum ve yönlendirmeyi okuyun)
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
C + +
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/gapfiller/ adresinden de alınabilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden çevrimiçi olarak en kolay şekilde çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
