Bu, en son sürümü MarDRe-v1.4.tar.gz olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak MarDRe adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için MarDRe adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
MarDRe, Linux'ta çevrimiçi çalışacak
Ad
TANIM
MarDRe, FASTQ/FASTA veri kümelerinden tek uçlu ve çift uçlu dizilerin kümelenmesi yoluyla çift ve çifte yakın DNA okumalarını kaldırmak için de novo MapReduce tabanlı paralel bir araçtır. Bu araç, biyoinformatiğin gerekli olmayan okumaların analizinden kaçınmasını sağlayarak veri seti ile sonraki prosedürlerin süresini azaltır.MarDRe, çok çekirdekli sistemlerde çalışma süresini azaltmak için HPC teknolojilerini (yani hibrit MPI/çoklu iş parçacığı) kullanan ParDRe'nin (yukarıdaki bağlantı) Büyük Veri karşılığıdır. Bunun yerine MarDRe, dağıtılmış sistemlerde, özellikle bulut tabanlı altyapılarda ParDRe performansını önemli ölçüde iyileştirmek için MapReduce programlama modelinden yararlanır. Platformlar arası uyumluluğu en üst düzeye çıkarmak için saf Java ile yazılan MarDRe, Büyük Veri işleme için en popüler dağıtılmış bilgi işlem çerçevesi olan açık kaynaklı Apache Hadoop projesi üzerine kurulmuştur.
Seyirci
Bilgi Teknolojisi, Sağlık Sektörü, Bilim/Araştırma
Kullanıcı arabirimi
Konsol/Terminal, Komut satırı
Programlama dili
Java
Bu, https://sourceforge.net/projects/mardre/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
