Bu, en son sürümü MetaWatt-3.5.3.zip olarak indirilebilen metawatt adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile metawatt adlı bu uygulamayı ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
metavat
TANIM
Metawatt binner, tetranükleotit frekanslarının çok değişkenli istatistiklerini ve diferansiyel kapsama dayalı gruplamayı kullanan bir grafik gruplama aracıdır. Ayrıca gruplama kalitesinin taksonomik değerlendirmesini de gerçekleştirir (elmas BLASTx aracılığıyla). Oluşturulan çöp kutuları düzenlenebilir ve fasta olarak dışa aktarılabilir. Metawatt, Java SWING'de uygulanır ve SVG grafiklerinin dışa aktarımı için Diamond, HMMer3.1, BBMap, Prodigal ve Batik kitaplığına minimum düzeyde bağlıdır.
Alıntı: Strous M, Kraft B, Bisdorf R, TegetMeyer H (2012) Karışık kültürlerin mikrobiyal fizyolojisi için metagenomik kontiglerin gruplanması. Mikrobiyal Fizyoloji ve Metabolizmada Sınırlar 3:410. doi: 10.3389/fmicb.2012.00410
Özellikler
- Metagenomik bitişiklerin birleşik tetranükleotid ve diferansiyel kapsama gruplaması
- Veri keşfi için grafiksel kullanıcı arayüzü
- Diamond blastp ile Kutuların Taksonomik Profili
- Korunmuş Tek Kopya Genlerin Tespiti
- Korunan genlere dayalı siloların filogenetik ağaçlandırılması
- Etkileşimli GC/kapsam veya kapsam/kapsam grafikleri
- Ayrıca komut satırında tam otomatik olarak çalışır
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Java Salıncak
Programlama dili
Java
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/metawatt/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
