Bu, en son sürümü pipe1.0.tar.gz olarak indirilebilen MspJI-seq_pipeline1.0 adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
MspJI-seq_pipeline1.0 adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
MspJI-seq_pipeline1.0
Ad
TANIM
MspJI-seq_pipeline1.0, DNA metilasyon çalışmasında MspJI-sindirme dizilemesi için boru hattıdır. Yeni nesil dizileme ile birleştirilmiş modifikasyona bağlı kısıtlama endonükleaz MspJI sindirimi, yüksek verimli okumaları referans dizilere eşleyerek genomdaki "CNNR" Sitozin lokasyonunun metilasyon durumunu tahmin edebilir. MspJI-seq_pipeline1.0, MspJI-seq'in bu özel özelliklerini işlemek için genel amaçlı bir haritalama programı olarak tasarlanmıştır. Hizalaması, açık kaynak programı SOAP'a (Kısa Oligo Hizalama Programı) dayanmaktadır ve mCNNR siteleri tanıma, perl'deki düzenli ifade ile gerçekleştirilir.
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
Perl
Veritabanı Ortamı
Düz bir dosya
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/mspjiseqpipelin/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.