Bu, en son sürümü PyPedal-2.0.3.zip olarak indirilebilen PyPedal adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
PyPedal adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
PyPedal
TANIM
PyPedal, soyağaçlarının işlenmesi, soyağaçlarının basit görselleştirilmesi ve soyağaçlarından genetik çeşitlilik ölçülerinin hesaplanması için araçlar sağlayan bir Python modülüdür.
Özellikler
- Soyağacı dosyalarını kullanıcı tanımlı formatlarda okuma
- Soyağacı bütünlüğünü kontrol etme (yinelenen kimlikler, çocuklarından küçük ebeveynler vb.)
- Soyağacı dosyasında görünme sıklığı gibi özet bilgiler oluşturma
- Soyağacı dosyalarının yeniden sıralanması ve yeniden numaralandırılması
- Tablo yöntemi kullanılarak bir soyağacı dosyasından pay ilişki matrisinin (A) hesaplanması
- Büyük soyağacı için akrabalı yetiştirme hesaplamaları
- Akrabalı yetiştirme ve ilişkinin ortalama toplam ve ortalama bireysel katsayılarının hesaplanması
- Kısmi akrabalı yetiştirme katsayılarının yinelemeli bir tablo yöntemi kullanılarak hesaplanması (Lacy, 1996; Gulisija, 2006)
- Ballou (1997) veya Suwanlee et al. (2007)
- Teorik ve fiili etkin popülasyon büyüklüklerinin hesaplanması
- Lacy'nin kesin algoritmasını kullanarak etkin kurucu numarasının hesaplanması
- Boichard ve arkadaşlarının yaklaşık algoritmasını kullanarak etkin kurucu numarasının hesaplanması.
- Boichard ve arkadaşlarının algoritmalarını kullanarak etkin ata sayısının hesaplanması.
- Bir hayvanın tüm atalarını içeren alt soyların seçimi
- İki hayvanın ortak akrabalarının belirlenmesi
- Muhtemel bir çiftleşmeden doğan yavruların akrabalı çiftleştirilmesinin hesaplanması
- Matrisler, akrabalı yetiştirme ve ilişki katsayıları ve özet bilgiler dahil olmak üzere ASCII metin dosyalarına çıktı
- GEDCOM 5.5 dosyalarının içe ve dışa aktarımı
- GENES 1.20 (dBase III) dosyalarının içe ve dışa aktarımı
- Soyağacı bilgilerini MySQL, Postgres ve SQLite veritabanlarından yükleme ve bunlara kaydetme
- Matvec 1.1a'dan türetilen bir algoritma kullanarak soyağacı simülasyonu
Seyirci
Eğitim, Bilim/Araştırma
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
Python
Veritabanı Ortamı
MySQL, PostgreSQL (pgsql), SQLite
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/pypedal/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
