Bu, son sürümü SOAPdenovo2-src-r2.tgz olarak indirilebilen SOAPdenovo240 adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
SOAPdenovo2 adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
SABUNdenovo2
Ad
TANIM
SOAPdenovo2'nin yanında ne var:
MEGAHIT, SOAPdenovo2'nin resmi halefidir
MEGAHIT: Kısa ve öz Bruijn grafiği aracılığıyla büyük ve karmaşık metagenomik montajı için ultra hızlı tek düğümlü çözüm
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
GitHub'daki En Son Kod:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo, insan boyutundaki genomlar için de novo taslak derleme oluşturabilen yeni bir kısa okuma derleme yöntemidir. Program, Illumina kısa okumalarını birleştirmek için özel olarak tasarlanmıştır. Referans dizileri oluşturmak ve keşfedilmemiş genomların doğru analizlerini uygun maliyetli bir şekilde gerçekleştirmek için yeni fırsatlar yaratır. SOAPdenovo2, SOAPdenovo'nun halefidir. SOAPdenovo2'den alıntı yapmak istiyorsanız GigaScience'da yayınlanan makaleye (aşağıdaki web sitesine bakın) alıntı yapın.
Seyirci
Bilim/Araştırma, Geliştiriciler
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
C++, C
Veritabanı Ortamı
Düz bir dosya
Bu, https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
