Bu, en son sürümü AsmSV.zip olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak SOAPsv adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için SOAPsv adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
SOAPsv Linux'ta çevrimiçi çalışacak
Ad
TANIM
Bu, güvenilir homozigot yapısal varyasyon tanımlaması için önceki yöntemleri tamamlayan bir yaklaşımdır. Yaklaşımımız, Illumina Genome Analyzer sıralama verilerinin de novo montajına dayalı olarak bir referans genoma göre genotipi ve kesme noktalarını doğru bir şekilde belirler. Bu yöntemde sadece homozigot yapısal varyasyonları inceledik çünkü heterozigot yapısal varyasyonları tespit etmek, mevcut birleştiriciler kullanılarak henüz mümkün olmayan haplotip dizilerinin birleştirilmesini gerektiriyor.Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
AWK, C++, Perl, Unix Kabuğu
Bu, https://sourceforge.net/projects/soapsv/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
