Bu, SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster adlı Linux uygulamasıdır ve en son sürümü swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz olarak indirilebilen çevrimiçi Linux'ta çalışır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster adlı bu uygulamayı çevrimiçi indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
SWAPHI-LS: Linux'ta çevrimiçi çalıştırmak için Xeon Phi Kümesi üzerinde hizalama
Ad
TANIM
Uzun DNA dizilerinin hizalanmasını hızlandırmak için Intel Xeon Phi kümelerinden yararlanan ilk paralel Smith-Waterman algoritması. Bu algoritma, C++ (bir dizi SIMD dahili uzantısı ile), OpenMP ve MPI ile yazılmıştır. Performans değerlendirmesi, algoritmamızın çok kararlı bir performans elde ettiğini ve tek bir Xeon Phi'de 30.1 GCUPS'a ve bir ana bilgisayarı paylaşan dört Xeon Phi'de 111.4 GCUPS'ye kadar performans sağladığını ortaya koydu.Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Konsol/Terminal, Komut satırı
Programlama dili
C + +
Bu, https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
