Bu, son sürümü tvscript.zip olarak indirilebilen TVscript adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile TVscript adlı bu uygulamayı ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
TV yazısı
TANIM
TVscript, kullanıcının, kullanıcı tarafından belirlenen bir eşikten daha büyük olan koşul içi okuma sayısı değişimiyle ilişkili transkriptlerin kaldırılmasını keşfetmesine olanak sağlamak üzere tasarlanmış bir araçtır. Bu tür transkriptlerin bulunmadığı orijinal girdi verilerinden bir dizi güncellenmiş sayım dosyası üretilir. Bu güncellenmiş sayım dosyaları daha sonra aşağı akış analizinde, örneğin diferansiyel olarak ifade edilen transkriptlerin tanımlanmasında kullanılabilir. İkincisinde, koşul içi varyasyonun kapsamı, bu görev için tasarlanmış farklı yazılımlar arasında tanımlanan genlerin nihai listelerini belirsiz ve tutarsız bir şekilde etkiler. Bu tür varyasyonları değişen eşik değerlerinde ortadan kaldırmanın etkilerini keşfedebilmek, hem diferansiyel ifade analizine hem de bu tür verileri kullanan diğer araştırma alanlarına ilişkin sezgisel içgörüyü artırır. Tüm ayrıntılar ve köpekgillerin evcilleştirilmesiyle ilgili transkriptomik verileri içeren iki vaka çalışması makalemizde mevcuttur: bağlantı kısa süre içinde mevcut olacaktır.
Özellikler
- RNA-seq veri kümeleri boyunca koşul içi varyasyonun etkilerinin araştırılması
- İndirme klasöründeki eksiksiz test verileri örneği
- Yürütülebilir jar dosyası, herhangi bir platformda çalışır
- Kurulumu kolay, sadece klasörü açın
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Konsol/Terminal
Programlama dili
Java
Bu, https://sourceforge.net/projects/tvscript/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
