![Çevrimiçi Ubuntu, çevrimiçi Fedora veya çevrimiçi Debian'da çalıştırmak için ViralFusionSeq [VFS] Linux uygulamasını ücretsiz indirin](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]icon.png_3.webp "Çevrimiçi Ubuntu'da, çevrimiçi Fedora'da veya çevrimiçi Debian'da çevrimiçi çalıştırmak için ViralFusionSeq [VFS] Linux uygulaması indirildi")
Bu, en son sürümü vfs-2016-08-17.r2.tar.gz olarak indirilebilen ViralFusionSeq [VFS] adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
ViralFusionSeq [VFS] adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
![Web aracını veya web uygulamasını indirin ViralFusionSeq [VFS]](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]screenshot1.png_3.webp "Web aracını veya web uygulamasını indirin ViralFusionSeq [VFS]")
![Web aracını veya web uygulamasını indirin ViralFusionSeq [VFS]](https://www.onworks.net/imagescropped/viralfusionseq[vfs]screenshot2.png_3.webp "Web aracını veya web uygulamasını indirin ViralFusionSeq [VFS]")
ViralFusionSeq [VFS]
TANIM
VFS, Ubuntu/Debian sistemi altında tamamen test edilmiştir.** Duyuru 1**: VFS, Virus-Clip'ten üstündür. https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/files/VFS.vs.Virus-Clip.pdf/download
2016 itibariyle VFS, NIH HPC sisteminde mevcut olan tek viral entegrasyon aracıdır.
https://hpc.nih.gov/apps/ViralFusionSeq/
ViralFusionSeq (VFS), viral entegrasyon olaylarını keşfetmek ve füzyon transkriptlerini tek tabanlı çözünürlükte yeniden yapılandırmak için çok yönlü bir yüksek verimli sıralama (HTS) aracıdır.
VFS, viral-insan füzyon olaylarını keşfetmek ve açıklama eklemek için yumuşak kırpma bilgilerini, çift okuma analizini ve hedeflenen de novo derlemeyi birleştirir.
Füzyon sınır değerlerinin kalitesini değerlendirmek için basit ama etkili bir ampirik istatistiksel model kullanılır.
Minimum kullanıcı tanımlı parametreler gereklidir.
Kullanım kılavuzu ve VFS kurulum kılavuzu ile kaynak kodu, sourceforge'un "Dosyalar" bölümünde mevcuttur.
atıf: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
Özellikler
- Uygulanabilir ve RNA-Seq ve DNA-Seq verileri kullanılarak tamamen test edilmiştir
- Viral entegrasyonu keşfetmek için hem kırpılmış dizi (CS) hem de eşleştirilmiş uç (RP) bilgilerini kullanın
- CS ve RP bilgilerini kullanarak füzyon transkript dizisinin yeniden yapılandırılması
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
Perl
Bu, https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
