Bu, en son sürümü VarScan.v2.3.9.jar olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux üzerinden Windows'ta çevrimiçi olarak çalışan VarScan adlı Windows uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux üzerinden Windows'ta çevrimiçi çalıştırmak için VarScan adlı bu uygulamayı ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden herhangi bir OS OnWorks çevrimiçi öykünücüsünü başlatın, ancak daha iyi Windows çevrimiçi öykünücüsü.
- 5. Yeni başlattığınız OnWorks Windows işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin ve kurun.
- 7. Wine'ı Linux dağıtımları yazılım havuzlarınızdan indirin. Kurulduktan sonra, Wine ile çalıştırmak için uygulamaya çift tıklayabilirsiniz. Ayrıca, popüler Windows programlarını ve oyunlarını yüklemenize yardımcı olacak Wine üzerinden gösterişli bir arayüz olan PlayOnLinux'u da deneyebilirsiniz.
Wine, Windows yazılımını Linux üzerinde çalıştırmanın bir yoludur, ancak Windows gerektirmez. Wine, Windows programlarını doğrudan herhangi bir Linux masaüstünde çalıştırabilen açık kaynaklı bir Windows uyumluluk katmanıdır. Esasen Wine, Windows'a ihtiyaç duymadan tüm bu Windows uygulamalarını çalıştırabilmesi için yeterince Windows'u sıfırdan yeniden uygulamaya çalışıyor.
EKRAN
Ad
VarScan, Windows'ta çevrimiçi Linux üzerinden çevrimiçi çalışacak
TANIM
Büyük ölçüde paralel sıralamada varyant algılama. Bir örnek için SNP'leri, indelleri ve konsensüs genotiplerini çağırır. Tümör-normal çiftler için, her bir varyantı Germline, Somatic veya LOH olarak ayrıca sınıflandırır ve ayrıca somatik kopya numarası değişikliklerini tespit eder. SON VERSİYON GITHUB'DA MEVCUTTURÖzellikler
- SAMtools yığın dosyalarından SNP'leri ve Indel'leri çağırır
- Kapsama, okuma derinliğine, değişken frekansına ve temel kaliteye göre değişkenleri filtreler
- Tümör-Normal çiftleri için somatik durumu (Somatik, Germline, LOH) belirler
- İki varyant listesini karşılaştırır, birleştirir ve kesişir
- Varyant çağrılarını bir dizi hedef pozisyon veya hedef bölge ile sınırlar
- Reklam amaçlı olmayan kullanımlar için bedava.
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
Java
Bu, https://sourceforge.net/projects/varscan/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
