Це команда createChemistryHeader, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн емулятор Windows або онлайн емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
createChemistryHeader.py - Створіть заголовок SAM з хімією послідовності PacBio
інформація
ОПИС
використання: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES ...]
вхідний_файл_вирівнювання вихідний_файл_заголовка
createChemistryHeader створює заголовок SAM, який містить інформацію про хімію, яку використовує
Сагайдак.
позиційний аргументи:
вхідний_файл_вирівнювання
Файл SAM або BAM, створений BLASR.
вихідний_заголовок
Назва заголовного файлу SAM або BAM, який буде створено з хімічною інформацією
завантажений.
необов'язковий аргументи:
-h, --допомога
показати це повідомлення довідки та вийти
--відлагоджувати
Вивести детальну інформацію журналу. (за замовчуванням: False)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ...]
Файли bas або bax, що містять читання, вирівняні в файлі
input_alignment_file. Також може бути fofn файлів bas або bax. (за замовчуванням: немає)
Використовуйте createChemistryHeader онлайн за допомогою служб onworks.net
