Це команда einvertede, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
einverted – знаходить інвертовані повтори в нуклеотидних послідовностях
СИНТАКСИС
перевернутий - послідовність seqall - розрив ціле -поріг ціле - матч ціле
- невідповідність ціле [- максимальне повторення ціле] - вихідний файл вихідний файл -outseq seqout
перевернутий -допомога
ОПИС
перевернутий — це програма командного рядка від EMBOSS («Європейська молекулярна біологія Open
Пакет програмного забезпечення»). Це частина команди "Nucleic:Repeats,Nucleic:2D structure".
група(и).
ВАРІАНТИ
вхід розділ
- послідовність seqall
Вимагається розділ
- розрив ціле
Значення за замовчуванням: 12
-поріг ціле
Значення за замовчуванням: 50
- матч ціле
Значення за замовчуванням: 3
- невідповідність ціле
Значення за замовчуванням: -4
Додатковий розділ
- максимальне повторення ціле
Максимальний відрив між початком повтору та кінцем інвертованого повтору.
Значення за замовчуванням: 2000
Вихід розділ
- вихідний файл вихідний файл
-outseq seqout
Послідовність інвертованих повторюваних областей без символів пропуску.
Використовуйте einvertede онлайн за допомогою служб onworks.net
