Це команда gt-convertseq, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн емулятор Windows або онлайн емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
gt-convertseq - Розбір та конвертація форматів файлів послідовності (FASTA/FASTQ, GenBank, EMBL).
СИНТАКСИС
gt convertseq [параметри] файл [...]
ОПИС
-v [так|ні]
бути багатослівним (за замовчуванням: ні)
-r [так|ні]
зворотні послідовності доповнення (за замовчуванням: ні)
-показати значення довжини файлу [так|ні]
показати довжину файлів (за замовчуванням: ні)
-seq [так|ні]
не показувати послідовності (за замовчуванням: ні)
-швидка ширина [значення]
Ширина вихідної лінії FASTA, 0 для необмеженої кількості (за замовчуванням: 60)
-contractdnawc [так|ні]
замінити ділянки підстановки ДНК на один N (за замовчуванням: ні)
-contractproteinwc [так|ні]
замінити відрізки підстановки білка на один X (за замовчуванням: ні)
-o [ім'я файлу]
переспрямувати вихід у вказаний файл (за замовчуванням: не визначено)
-gzip [так|ні]
записати стиснений вихідний файл gzip (за замовчуванням: ні)
-bzip2 [так|ні]
записати стиснений вихідний файл bzip2 (за замовчуванням: ні)
- сила [так|ні]
примусово записувати у вихідний файл (за замовчуванням: ні)
-допомога
відобразити довідку та вийти
-версія
відобразити інформацію про версію та вийти
ЗВІТНІСТЬ БУГИ
Повідомте про помилки до[захищено електронною поштою]>.
Використовуйте gt-convertseq онлайн за допомогою служб onworks.net
