gt-inlineseq_add - онлайн у хмарі

ПРОГРАМА:

ІМ'Я

gt-inlineseq_add - додає вбудовані послідовності із зовнішнього джерела до вхідних даних GFF3.

СИНТАКСИС

gt inlineseq_add [параметри] [GFF3_файл ...]

ОПИС

-seqfile [ім'я файлу]
встановити файл послідовності, з якого будуть брати послідовності (за замовчуванням: не визначено)

-encseq [ім'я файлу]
встановити ім’я індексу закодованої послідовності, з якого брати послідовності (за замовчуванням:
невизначено)

-seqfiles
встановіть файли послідовності, з яких витягуватиме використання функцій -- щоб завершити список
файлів послідовності

- matchdesc [так|ні]
пошук потрібних ідентифікаторів послідовності в описах послідовностей у вхідних файлах (в
GFF3), повідомляє про перший матч (за замовчуванням: ні)

-matchdescstart [так|ні]
точно відповідати описам послідовності з вхідних файлів для потрібної послідовності
Ідентифікатори (у GFF3) від початку до першого пробілу (за замовчуванням: ні)

-usedesc [так|ні]
використовуйте описи послідовностей, щоб зіставити ідентифікатори послідовностей (у GFF3) з фактичною послідовністю
записи. Якщо опис містить діапазон послідовності (наприклад, III:1000001..2000000),
перша частина використовується як ідентифікатор послідовності (III) і позиція першого діапазону як зміщення
(1000001) (за замовчуванням: ні)

-картографування регіонів [рядок]
встановити файл, що містить область послідовності, на відображення файлу послідовності (за замовчуванням: не визначено)

-o [ім'я файлу]
переспрямувати вихід у вказаний файл (за замовчуванням: не визначено)

-gzip [так|ні]
записати стиснений вихідний файл gzip (за замовчуванням: ні)

-bzip2 [так|ні]
записати стиснений вихідний файл bzip2 (за замовчуванням: ні)

- сила [так|ні]
примусово записувати у вихідний файл (за замовчуванням: ні)

-допомога
відобразити довідку та вийти

-версія
відобразити інформацію про версію та вийти

ЗВІТНІСТЬ БУГИ

Повідомте про помилки до[захищено електронною поштою]>.

Використовуйте gt-inlineseq_add онлайн за допомогою сервісів onworks.net