Це команда maf-convert, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks, використовуючи одну з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS.
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
maf-convert - Перетворення вирівнювань у форматі MAF у табличний формат
ОПИС
Використання:
maf-конвертувати --допомога maf-convert axt mafFile(s) maf-convert blast mafFile(s)
maf-convert blasttab mafFile(s) maf-convert html mafFile(s) maf-convert psl
mafFile(s) maf-convert sam mafFile(s) maf-convert tab mafFile(s)
Прочитайте вирівнювання у форматі MAF і запишіть їх в іншому форматі.
ВАРІАНТИ
-h, --допомога
показати це повідомлення довідки та вийти
-p, --білок
припустимо вирівнювання білка для підрахунку збігів psl
-n, --без заголовка
пропустити будь-які рядки заголовка з виводу
-d, -- словник
включити словник довжин послідовності у форматі sam
-f DICTFILE, --dictfile=DICTFILE
отримати словник послідовності з DICTFILE
-r READGROUP, --readgroup=READGROUP
прочитати інформацію про групу для формату Sam
-l РОЗМІР ЛІНІЇ, --розмір лінії=РОЗМІР ЛІНІЇ
довжина рядка для форматів blast і html (за замовчуванням: 60)
Використовуйте maf-convert онлайн за допомогою служб onworks.net
