mia-3dfluid - онлайн у хмарі

ПРОГРАМА:

ІМ'Я

mia-3dfluid - рідиннодинамічна 3D реєстрація

СИНТАКСИС

mia-3dfluid -i -r -o [параметри]

ОПИС

mia-3dfluid Ця програма використовується для нежорсткої реєстрації на основі гідродинаміки як
описано в: Wollny, G. and Kruggel, F., «Обчислювальна вартість нежорсткої реєстрації
алгоритми, засновані на динаміці рідини, IEEE Transactions on Medical Imaging, 11(8), с.
946-952, 2002, doi: 10.1109/TMI.2002.803113. Він використовує SSD як єдину реєстрацію
критерій.

ВАРІАНТИ

Файл-IO
-i --in-image=(вхід, обов'язковий); io
вхідне зображення. Щоб дізнатися про підтримувані типи файлів, див. ПЛАГІНИ:3dimage/io

-r --ref-image=(вхід, обов'язковий); io
довідкове зображення. Докладніше про підтримувані типи файлів див. у ПЛАГІНАХ:3dimage/io

-o --out-transformation=(вихід, обов'язковий); io
вихідне перетворення, що містить поле перетворення реєстрації For
підтримувані типи файлів див. ПЛАГІНИ:3dtransform/io

-d --out-image=(вихід); io
зберегти деформоване зображення. Щоб дізнатися про підтримувані типи файлів, див. ПЛАГІНИ:3dimage/io

Документи & інформація
-V --verbose=попередження
детальність виводу, друк повідомлень заданого рівня та вищих пріоритетів.
Підтримувані пріоритети, починаючи з найнижчого рівня:
info - Повідомлення низького рівня
простежувати ‐ Трасування виклику функції
невдача - Повідомляйте про помилки тестування
попередження - Попередження
помилка - Повідомити про помилки
відлагоджувати ‐ Вихід налагодження
повідомлення - Звичайні повідомлення
фатальний - Повідомляйте лише про фатальні помилки

-- авторське право
роздрукувати інформацію про авторські права

-h --допомога
роздрукувати цю довідку

-? --використання
надрукувати коротку довідку

-- версія
надрукувати номер версії та вийти

Обробка
--threads=-1
Максимальна кількість потоків для обробки, це число має бути меншим
або дорівнює кількості ядер логічного процесора в машині. (-1:
автоматична оцінка).Максимальна кількість потоків для обробки,Це
число має бути меншим або дорівнювати кількості ядер логічного процесора в
машина. (-1: автоматична оцінка).

Реєстрація параметри
--disable-multigrid
вимкнути обробку в кількох мережах

--disable-fullres
вимкнути обробку зображення з повною роздільною здатністю

--лямбда=1
константа пружностіпостійна пружності

--mu=1
константа пружностіпостійна пружності

-s --start-size=16
початковий багатосітковий розмірпочатковий багатосітковий розмір

-m --method=sora
метод розв'язування ПДЕ
сор - послідовне надмірне розслаблення
Сора - Релексація Гаусса Саутвелла

--крок=0.8
Початковий розмір крокуПочатковий розмір кроку

-p --інтерполятор=bspline:d=3
image interpolator kernelimage interpolator kernel Для підтримуваних плагінів
див. ПЛАГІНИ:1d/splinekernel

--розслабитися=1
фактор надмірної релаксації vor method soroverrelaxation factor vor method sor

--maxiter=10
максимальні ітераціїмаксимальні ітерації

--епсилон=0.01
умова скорочення

--матерія=4
інтенсивність, вище якої реальна матерія вважається (експериментальною) інтенсивністю вище
яка реальна матерія передбачається (експериментальна)

ПЛАГІНИ: 1d/splinekernel

bspline Створення ядра B-сплайна, підтримувані параметри:

d = 3; int в [0, 5]
Ступінь сплайна.

омомс Створення ядра OMoms-spline, підтримувані параметри:

d = 3; int в [3, 3]
Ступінь сплайна.

ПЛАГІНИ: 3dimage/io

аналізувати Проаналізуйте зображення 7.5

Розпізнані розширення файлів: .HDR, .hdr

Підтримувані типи елементів:
без знака 8 біт, зі знаком 16 біт, зі знаком 32 біт, з плаваючою комою 32 біт,
з плаваючою комою 64 біт

пул даних Віртуальний IO до та з внутрішнього пулу даних

Розпізнані розширення файлів: .@

dicom Серія зображень Dicom у вигляді 3D

Розпізнані розширення файлів: .DCM, .dcm

Підтримувані типи елементів:
зі знаком 16 біт, без знаку 16 біт

hdf5 HDF5 3D зображення IO

Розпізнані розширення файлів: .H5, .h5

Підтримувані типи елементів:
двійкові дані, 8 біт зі знаком, 8 біт без знака, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака,
32-розрядний зі знаком, 32-розрядний без знака, 64-розрядний зі знаком, 64-розрядний без знака, плаваючий
точка 32 біт, з плаваючою комою 64 біт

інрія Зображення INRIA

Розпізнані розширення файлів: .INR, .inr

Підтримувані типи елементів:
8 біт зі знаком, 8 біт без знаку, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака, 32 зі знаком
біт, беззнаковий 32 біт, з плаваючою комою 32 біт, з плаваючою комою 64 біт

mhd MetaIO 3D image IO з використанням реалізації VTK (експериментальний).

Розпізнані розширення файлів: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Підтримувані типи елементів:
8 біт зі знаком, 8 біт без знаку, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака, 32 зі знаком
біт, беззнаковий 32 біт, з плаваючою комою 32 біт, з плаваючою комою 64 біт

nifti NIFTI-1 3D зображення IO

Розпізнані розширення файлів: .NII, .nii

Підтримувані типи елементів:
8 біт зі знаком, 8 біт без знаку, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака, 32 зі знаком
біт, 32-розрядний без знака, 64-розрядний зі знаком, 64-розрядний без знака, з плаваючою комою 32
біт, з плаваючою комою 64 біт

vff VFF Sun растровий формат

Розпізнані розширення файлів: .VFF, .vff

Підтримувані типи елементів:
без знака 8 біт, зі знаком 16 біт

перспектива 3D-перегляд

Розпізнані розширення файлів: .V, .VISTA, .v, .vista

Підтримувані типи елементів:
двійкові дані, 8 біт зі знаком, 8 біт без знака, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака,
32 біт зі знаком, 32 біт без знаку, 32 біт з плаваючою комою, 64 з плаваючою комою
біт

vti Вхід і вихід 3D-зображення VTK-XML (експериментальний).

Розпізнані розширення файлів: .VTI, .vti

Підтримувані типи елементів:
8 біт зі знаком, 8 біт без знаку, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака, 32 зі знаком
біт, беззнаковий 32 біт, з плаваючою комою 32 біт, з плаваючою комою 64 біт

vtk 3D VTK зображення застарілих вхід і вихід (експериментальний).

Розпізнані розширення файлів: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Підтримувані типи елементів:
двійкові дані, 8 біт зі знаком, 8 біт без знака, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака,
32 біт зі знаком, 32 біт без знаку, 32 біт з плаваючою комою, 64 з плаваючою комою
біт

ПЛАГІНИ: 3dtransform/io

BBS Бінарний (непереносний) серійний ввод-ввод із тривимірних перетворень

Розпізнані розширення файлів: .bbs

пул даних Віртуальний IO до та з внутрішнього пулу даних

Розпізнані розширення файлів: .@

перспектива Сховище 3D-перетворень Vista

Розпізнані розширення файлів: .v, .v3dt

XML XML серіалізований IO тривимірних перетворень

Розпізнані розширення файлів: .x3dt

приклад

Зареєструйте зображення test.v для зображення ref.v і запишіть поле вектора деформації regfield.v.
Почніть реєстрацію з найменшого розміру понад 16 пікселів.

mia-3dfluid -i test.v -r ref.v -o regfield.v -s 16

АВТОР(и)

Герт Волний

АВТОРСЬКЕ

Авторське право на це програмне забезпечення (c) 1999-2015, Лейпциг, Німеччина та Мадрид, Іспанія. Воно приходить
без АБСОЛЮТНО НІ ГАРАНТІЙ, і ви можете розповсюджувати його відповідно до умов GNU
ЗАГАЛЬНА ПУБЛІЧНА ЛІЦЕНЗІЯ Версія 3 (або новіша). Для отримання додаткової інформації запустіть програму за допомогою
параметр '--copyright'.

Використовуйте mia-3dfluid онлайн за допомогою служб onworks.net