Це програма для Linux під назвою COPEread, останню версію якої можна завантажити як cope-v1.2.5.tgz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою COPEread з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
COPEпрочитайте
Ad
ОПИС
COPE (Connecting Overlapped Pair-End Reads) — це метод вирівнювання та з’єднання зчитування парних кінців із секвенцією illumina, розмір вставки яких менший, ніж сума двох довжин зчитування. З’єднані зчитування можна використовувати для збирання геному, повторного секвенування і дослідження транскриптомів.
Повна цитата:
COPE: Точний інструмент підключення парного зчитування на основі k-mer для полегшення збирання геному
Бінхан Лю; Цзяньінь Юань; Сіу-Мін Ю; Женю Лі; Іньлун Се; Яньсян Чен; Юцзянь Ши; Хао Чжан; Інжуй Лі; Так-Ва Лам; Руйбанг Луо
Біоінформатика (2012) 28(22): 2870-2874; doi: 10.1093/bioinformatics/bts563
Функції
- підключити читання з накладеним кінцем пари
Мова програмування
C + +
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/coperead/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.