Це програма для Linux під назвою FastQC, останню версію якої можна завантажити як v0.12.1sourcecode.zip. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою FastQC з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
Швидкий контроль якості
ОПИС
FastQC — це інструмент аналізу контролю якості, розроблений для виявлення потенційних проблем у наборах даних високопродуктивного секвенування. Його мета — забезпечити простий спосіб перевірки якості необроблених даних послідовності, що надходять із високопродуктивних конвеєрів секвенування. Для цього виконується модульний набір аналізів одного або кількох необроблених файлів послідовності у форматі fastq або bam. Потім створюється звіт, у якому підсумовуються результати та виділяється будь-які області, де бібліотека може здатися незвичною. Тоді це має направити вас туди, де можуть виникнути проблеми з вашими даними, і дозволить вам вжити необхідних заходів, щоб виправити їх, перш ніж робити будь-який подальший аналіз.
FastQC не прив’язаний до якогось конкретного типу техніки секвенування, тому його можна використовувати для перегляду бібліотек різних типів експериментів (геномне секвенування, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq тощо).
Функції
- Імпортує дані з файлів BAM, SAM або FastQ
- Пропонує короткий огляд, який висвітлює потенційні проблемні області
- Зведені графіки та таблиці для швидкої оцінки даних
- Експортувати результати в HTML
- Можна використовувати офлайн
Мова програмування
Java
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
