Це програма для Linux під назвою MarDRe, останню версію якої можна завантажити як MarDRe-v1.4.tar.gz. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть цю програму під назвою MarDRe з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
MarDRe
Ad
ОПИС
MarDRe — це новий паралельний інструмент на основі MapReduce для видалення дублікатів і майже дублікатів зчитування ДНК через кластеризацію однокінцевих і парних послідовностей із наборів даних FASTQ/FASTA. Цей інструмент дозволяє біоінформатикам уникнути аналізу непотрібних зчитувань, скорочуючи час наступних процедур з набором даних.
MarDRe — аналог Big Data ParDRe (посилання вище), який використовує технології HPC (тобто гібридний MPI/багатопотоковість) для скорочення часу роботи на багатоядерних системах. Натомість MarDRe використовує переваги моделі програмування MapReduce для значного покращення продуктивності ParDRe у розподілених системах, особливо в хмарних інфраструктурах. Написаний на чистій Java для максимальної крос-платформної сумісності, MarDRe побудований на відкритому проекті Apache Hadoop, найпопулярнішій структурі розподіленого обчислення для обробки великих даних.
Аудиторія
Інформаційні технології, промисловість охорони здоров’я, наука/дослідження
Користувацький інтерфейс
Консоль/Термінал, командний рядок
Мова програмування
Java
Категорії
Це додаток, який також можна завантажити з https://sourceforge.net/projects/mardre/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було найпростіше запускати онлайн з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
