Це програма для Linux під назвою PRIMUS для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як URLtoLastestPRIMUSversion.txt. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою PRIMUS, щоб безкоштовно запускати в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
PRIMUS для запуску в Linux онлайн
ОПИС:
НОВЕ: завантажте нову версію з Pedigree Reconstruction на primus.gs.washington.eduЦя версія застаріла та неповна. Будь ласка, відвідайте новий веб-сайт для повної версії PRIMUS.
Ми представляємо метод, адаптований з теорії графів, який завжди визначає максимальний набір непов’язаних осіб у будь-якому наборі даних і дозволяє використовувати параметри зважування при відборі непов’язаної вибірки. PRIMUS зчитує згенеровані користувачами оцінки IBD і виводить максимально можливий набір непов’язаних осіб за заданого порога спорідненості. Також може бути використана додаткова інформація для пільгового відбору осіб. Наприклад, коли в мережі є два однакових за розміром максимальних набори непов’язаних осіб, PRIMUS може переважно вибрати набір з більшою кількістю постраждалих осіб.
Підпишіться на список розсилки PRIMUS-Users, щоб отримувати сповіщення про оновлення та нові версії.
Відповідне програмне забезпечення:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
Функції
- Визначає максимальний набір неспоріднених осіб із генетичного набору даних
- Групує зразки в сімейні мережі
- Генерує файли .dot для візуалізації сімейних мереж
Аудиторія
Промисловість охорони здоров'я, наука/дослідження, освіта
Мова програмування
Perl
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/primus-beta/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.