Це програма для Linux під назвою Virmid, останню версію якої можна завантажити як Virmid-1.2.0.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою Virmid з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
Вірмід
ОПИС
НОВИНИ:
11 Завантажено нову версію Virmid 07.
08 Доповідь Virmid опублікована в Genome Biology.
Кім С. та ін., «Вірмід: точне виявлення соматичних мутацій із висновком про домішки», Genome Biology 2013, 14:R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid (Virtual Microdisection для виклику SNP) — це варіант виклику на основі Java, розроблений для відповідних зразків для контролю захворювань. Virmid також спеціалізується на ідентифікації потенційного зараження в окремих випадках, коли зразок хвороби не може бути достатньо очищений. Хоча частота викликів SNP серйозно порушена через цю гетерогенність, Virmid може виявити SNP з низькою частотою алелів, враховуючи рівень забруднення (альфа). Важливими характеристиками Virmid є:
•Оцінка точного співвідношення контрольної проби у (змішаній) вибірці захворювання
• Покращений SNP та виклик соматичних мутацій щодо передбачуваної частки
Функції
- Виявлення соматичних мутацій
- Висновок про домішки
Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
Java
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/virmid/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
