Це програма для Windows під назвою iCAS — An Illumina Clone Assembly System для роботи в Windows онлайн через Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як icas_v062.tar.bz2. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою iCAS — An Illumina Clone Assembly System для запуску в Windows онлайн через Linux онлайн за допомогою OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
iCAS – система зборки клонів Illumina для роботи в Windows онлайн через Linux онлайн
Ad
ОПИС
Секвенування клон за клоном, як засіб досягнення високоякісних збірок для великих і складних геномів, продовжує мати велике значення в епоху високопродуктивного секвенування. Однак збірки, отримані з використанням сучасних ассемблерів цілого геному, часто фрагментовані і іноді мають проблеми з повнотою геному через різні характеристики даних, внесені мультиплексованим секвенуванням.З iCAS процес фільтрації даних базується на новому алгоритмі частоти kmer, що забезпечує майже ідеальне зчитування перед збіркою. Контиги генеруються за допомогою різних алгоритмів складання, а потім об’єднуються разом для досягнення більшої безперервності. Повторне вирівнювання всіх зчитування до контигів проекту та повторне калібрування кожної бази послідовності дозволяє досягти остаточного консенсусу. Використовуючи готові клони для контролю якості, конвеєр може отримувати збірки з охопленням клонів 99.7% і консенсусною базовою якістю Q39.
Розроблено в Wellcome Trust Sanger Institute.
Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
Перл, С
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/icas/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
