Đây là lệnh checktranse có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
checktrans - Báo cáo số liệu thống kê STOP codon và ORF của protein
SYNOPSIS
kiểm tra chuyển giao -sự nối tiếp tiếp theo -orfml số nguyên [-addlast boolean] -outfile ô uế
-outseq phần tiếp theo -đánh bại kỳ tích
kiểm tra chuyển giao -Cứu giúp
MÔ TẢ
kiểm tra chuyển giao là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Tổ chức Sinh học Phân tử Châu Âu Mở rộng
Bộ phần mềm"). Nó là một phần của lệnh "Nucleic: Tìm kiếm gen, Nucleic: Dịch"
các nhóm).
LỰA CHỌN
Đầu vào phần
-sự nối tiếp tiếp theo
Yêu cầu phần
-orfml số nguyên
Giá trị mặc định: 100
thêm vào phần
-addlast boolean
Dấu hoa thị trong chuỗi protein cho biết vị trí của codon STOP. Kiểm tra truyền
giả định rằng tất cả các ORF đều kết thúc bằng codon STOP. Buộc trình tự kết thúc bằng một
dấu hoa thị, nếu chưa có dấu hoa thị ở đó, sẽ khiến checktrans coi phần cuối là một
ORF tiềm năng. Nếu thêm dấu hoa thị, nó sẽ không được tính vào số lượng được báo cáo
DỪNG. Giá trị mặc định: Y
Đầu ra phần
-outfile ô uế
-outseq phần tiếp theo
Tệp trình tự để giữ các chuỗi ORF đầu ra
-đánh bại kỳ tích
Tệp cho các tính năng đầu ra
Sử dụng checktranse trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
