Đây là demux lệnh có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
demux - Chuyển đổi giới hạn khoảng cách XPLOR sang định dạng Gromacs
SYNOPSIS
giải trừ md0.log thêm
MÔ TẢ
Nếu bạn muốn làm cho quỹ đạo của mình liên tục trở lại, bạn có thể sử dụng giải trừ đọc
tệp md0.log của bạn (bạn có thể nối nhiều tệp nếu cần) và tạo ra một vài đầu ra
các tập tin. Một trong số này là tệp .xvg (bản sao_ndx.xvg) có thể được chuyển cho trjcat(1) dọc theo
với các tệp quỹ đạo ban đầu, để tạo ra các quỹ đạo liên tục. Cai khac
tập tin (bản sao_temp.xvg) chứa nhiệt độ cho mỗi bản sao, bắt đầu từ
nhiệt độ ban đầu. Vì vậy, nếu bản sao sở thích của bạn bắt đầu ở mức 300 K, bạn có thể theo dõi
quỹ đạo của nó qua không gian nhiệt độ. Sẽ rất thú vị nếu thêm một số
chức năng tạo biểu đồ phân bố nhiệt độ cho mỗi bản sao,
theo hầu hết các tác giả, nên được bằng phẳng. Các quỹ đạo được tách dòng có thể được sử dụng với
g_kinetic(1) để thu được động học gấp protein từ quỹ đạo REMD.
LỰA CHỌN
md0.log Tệp nhật ký của quá trình chạy quỹ đạo mà bạn muốn thực hiện liên tục. Nhiều tệp có thể được
nối với nhau.
thêm Số lần mỗi mục nhập trong tệp nhật ký sẽ được sao chép. (Số nguyên)
GIỚI HẠN
Nếu trao đổi của bạn là mỗi N ps và bạn tiết kiệm được mỗi M ps bạn có thể bù đắp cho phần còn thiếu
khung bằng cách thiết lập thêm thành (N / M - 1). Nếu N / M không phải là số nguyên, bạn không gặp may và bạn
sẽ không thể thay đổi quỹ đạo của bạn.
Sử dụng demux trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
