Đây là lệnh fastq_masker có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
fastq_masker - Mặt nạ nucleotide bằng 'N' (hoặc ký tự khác) dựa trên chất lượng
MÔ TẢ
cách sử dụng: fastq_masker [-h] [-v] [-q N] [-r C] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Một phần của FASTX
Bộ công cụ 0.0.14 của A. Gordon ([email được bảo vệ])
[-h] = Màn hình trợ giúp hữu ích này.
[-q N] = Ngưỡng chất lượng - nucleotide có chất lượng thấp hơn sẽ bị che
Mặc định là 10.
[-r C] = Thay thế nucleotide chất lượng thấp bằng ký tự C. Mặc định là 'N'
[-z] = Nén đầu ra bằng GZIP.
[-i THÔNG TIN]
= Tệp đầu vào FASTQ. mặc định là STDIN.
[-o OUTFILE] = Tệp đầu ra FASTQ. mặc định là STDOUT. [-v] = Verbose -
báo cáo số thứ tự.
Nếu [-o] được chỉ định,
báo cáo sẽ được in thành STDOUT.
Nếu [-o] không được chỉ định (và đầu ra chuyển đến STDOUT), báo cáo sẽ được in ra
STDERR.
Sử dụng fastq_masker trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
