Đây là lệnh garniere có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
garnier - Dự đoán cấu trúc bậc hai của protein bằng phương pháp GOR
SYNOPSIS
Trình bày -sự nối tiếp tiếp theo -idc số nguyên -outfile báo cáo
Trình bày -Cứu giúp
MÔ TẢ
Trình bày là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Tổ chức Sinh học Phân tử Châu Âu Mở rộng
Bộ phần mềm"). Nó là một phần của (các) nhóm lệnh "Protein: 2D Structure".
LỰA CHỌN
Đầu vào phần
-sự nối tiếp tiếp theo
Nâng cao phần
-idc số nguyên
Trong bài báo của họ, GOR đề cập rằng nếu bạn biết điều gì đó về cấu trúc phụ
nội dung của protein bạn đang phân tích, bạn có thể dự đoán tốt hơn. 'idc' là một
lập chỉ mục thành một tập hợp các mảng, dharr [] và dsarr [], cung cấp 'hằng số quyết định'
(dch, dcs), là các hiệu số được áp dụng cho trọng lượng của đường xoắn và tấm
(mở rộng) các điều khoản. Vì vậy, idc = 0 cho biết không sử dụng hiệu số hằng số quyết định và idc = 1 đến 6
chỉ ra rằng nên sử dụng các kết hợp khác nhau của các hiệu số dch, dcs.
Đầu ra phần
-outfile báo cáo
Sử dụng garniere trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net