Đây là lệnh gt-encseq-encode có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
gt-encseq-encode - Mã hóa các tệp trình tự (FASTA / FASTQ, GenBank, EMBL) một cách hiệu quả.
SYNOPSIS
gt encseq mã hóa chuỗi_tệp [chuỗi_tệp [chuỗi_tệp ...]]
MÔ TẢ
-showstats [có | không]
hiển thị kết quả nén (mặc định: không)
-ssp [có | không]
xuất các vị trí dấu phân cách trình tự vào tệp (mặc định: có)
-từ [có | không]
xuất mô tả trình tự vào tệp (mặc định: có)
-sds [có | không]
xuất các vị trí dấu phân cách mô tả trình tự vào tệp (mặc định: có)
-md5 [có | không]
xuất tổng MD5 vào tệp (mặc định: có)
-clipdesc [có | không]
đoạn mô tả sau khoảng trắng đầu tiên (mặc định: không)
-Đã ngồi [chuỗi]
chỉ định loại biểu diễn trình tự bằng một trong các từ khóa trực tiếp, bytecompress,
eqlen, bit, uchar, ushort, uint32 (mặc định: không xác định)
-dna [có | không]
đầu vào là chuỗi DNA (mặc định: không)
-chất đạm [có | không]
đầu vào là trình tự protein (mặc định: không)
-trơn [có | không]
xử lý dưới dạng văn bản thuần túy (mặc định: không)
-tên chỉ mục [chuỗi]
chỉ định tên cho chỉ mục sẽ được tạo (mặc định: không xác định)
-smap [chuỗi]
chỉ định tệp chứa ánh xạ ký hiệu (mặc định: không xác định)
-không mất mát [có | không]
cho phép truy xuất chuỗi gốc không mất dữ liệu (mặc định: không)
-v [có | không]
dài dòng (mặc định: không)
-Cứu giúp
hiển thị trợ giúp cho các tùy chọn cơ bản và thoát
-help +
hiển thị trợ giúp cho tất cả các tùy chọn và thoát
-phiên bản
thông tin phiên bản màn hình và thoát
BÁO CÁO GIỎI
Báo cáo lỗi cho[email được bảo vệ]>.
Sử dụng mã hóa gt-encseq trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
